プロテオームデータ解析システムについて −質量分析を中心に−
　（田畑　剛・石濱　泰・小田吉哉）

　プロテオーム解析では質量分析計（MS）から膨大な量の生データが得られるため，解析用のコンピュータには，より高速，高性能であることが求められる。そして生のMSスペクトルとデータベースから得られる理論値を照合してタンパク質を自動同定する検索エンジンは，誤同定も多いので注意が必要である。さらに，検索エンジンだけでなくMSスペクトルからピークを拾い出す過程も誤同定の原因となる。また，現在のデータベースは質的・量的に十分ではないこととMSではタンパク質の一部の配列を同定するに過ぎないため，１つのMSデータに対して複数のタンパク質名・遺伝子名がヒットし，結果の解釈に混乱を生じさせやすい。さらには，タンパク質を同定するだけでなく，定量したり，あるいは機能情報を付加したりすることも重要である。これらの課題に対応したツールの開発が望まれている。